In Your Arms gaat over de cynische en ongeneeslijk zieke 40-jarige Niels, die zijn leven wil beëindigen. Maar dit is bij de wet verboden in Denemarken.
Daarom gaat hij op zoek naar andere mogelijkheden. Hij komt erachter dat euthanasie in Zwitserland wel is toegestaan. Wanneer de onzekere en eenzame verpleegster Maria na een verzoek van de familie van Niels besluit mee te gaan, volgt een roadtrip via Hamburg naar Zwitserland, waarin ze elkaar steeds beter leren kennen.