Wayne Szalinski, een knotsgekke professor, probeert een machine te ontwerpen die levende wezens kan doen slinken
Zijn kinderen, Amy en Robert, activeren samen met twee vrienden per ongeluk de machine en tot hun grote schrik krimpen ze tot kleine wezentjes. Vervolgens worden ze door hun vader nietsvermoedend in de vuilnisbak gegooid. Dit is het begin van een hachelijk avontuur waarin alles plots vele malen groter is dan hen.